COVID-19 精選文獻(xiàn)
Incucyte? 文獻(xiàn)
https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1009165
Mor, M. et al. Multi-clonal SARS-CoV-2 neutralization by antibodies isolated from severe COVID-19 convalescent donors. PLoS Pathog 17(2): e1009165. 2021.
SARS-CoV-2 抗體、免疫細(xì)胞與疾病嚴(yán)重程度之間的關(guān)系尚不明確。本研究分析了重癥和輕癥 SARS-CoV-2 獻(xiàn)血者恢復(fù)期血液中抗體應(yīng)答的細(xì)胞、分子和功能特征。當(dāng)使用分離得到的抗 SARS-CoV-2 抗體時(shí)，作者通過(guò) Incucyte? S3 活細(xì)胞分析系統(tǒng)監(jiān)測(cè)了細(xì)胞死亡和細(xì)胞間融合。數(shù)據(jù)表明，重癥 COVID-19 觸發(fā)獨(dú)特的抗體應(yīng)答，可以為抗體雞尾酒療法提供信息。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 重癥獻(xiàn)血者抗 SARS-CoV-2 IgG 相對(duì)于刺突蛋白受體結(jié)合域 (RBD) 的滴度更高，并且 B 細(xì)胞擴(kuò)增更高。
- 在活細(xì)胞分析中，分離得到的 22 個(gè)單克隆抗體中有 6 個(gè)有效地中和了活病毒并阻止了合胞體的形成。肽庫(kù)、計(jì)算方法和突變分析一同揭示了抗體結(jié)合的機(jī)制。
- 分離的中和抗體雞尾酒療法阻止了細(xì)胞培養(yǎng)中病毒的復(fù)制。
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.17.156455v1.abstract
Stukalov, A. et at. Multi-level proteomics reveals host-perturbation strategies of SARS-CoV-2 and SARS-CoV, 2020. doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.17.156455
開發(fā)針對(duì) SARS-CoV2 的治療方法需要更好地了解病毒蛋白與宿主蛋白之間的相互作用。這項(xiàng)蛋白質(zhì)組學(xué)研究表征了 SARS-CoV-2 及相關(guān)冠狀病毒感染中涉及的病毒 - 宿主中蛋白質(zhì)相互作用和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程。這些數(shù)據(jù)揭示了可以通過(guò)已知藥物調(diào)控從而改變冠狀病毒感染過(guò)程的獨(dú)特和常見的通路。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定了 1086 種細(xì)胞蛋白與 24 種 SARS-CoV-2 和 27 種 SARS-CoV 引誘蛋白之間的 1484 種相互作用，表明它們涉及一系列生物學(xué)過(guò)程。
- 綜合數(shù)據(jù)顯示，應(yīng)激和 DNA 損傷反應(yīng)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和細(xì)胞連接組織等關(guān)鍵途徑均參與了感染過(guò)程。
- 使用 48 種臨床批準(zhǔn)的化合物對(duì)這些通路進(jìn)行靶向選擇性分析，識(shí)別出對(duì) SARS-CoV2 具有顯著抗病毒活性的激酶和基質(zhì)金屬蛋白酶抑制劑。作者使用了 Incucyte? S3 活細(xì)胞分析系統(tǒng)進(jìn)行延時(shí)熒光病毒檢測(cè)。
iQue? 文獻(xiàn)
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33514825/
Dogan, M. et al. SARS-CoV-2 specific antibody and neutralization assays reveal the wide range of the humoral immune response to virus. Commun Biol. 4(1):129. 2021.
了解 COVID-19 抗體響應(yīng)的數(shù)量、質(zhì)量和持續(xù)時(shí)間對(duì)疫苗的開發(fā)至關(guān)重要。本研究通過(guò)開發(fā)高度敏感和特異性的 SARS-CoV-2 抗體及抗體中和檢測(cè)方法，填補(bǔ)了該領(lǐng)域中的一個(gè)重大空白。在 iQue? 高通量流式細(xì)胞儀上進(jìn)行 SARS-CoV-2 蛋白抗體結(jié)合篩查。作者用該試驗(yàn)證明了 COVID-19 患者的多種體液免疫應(yīng)答。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 基于微球的熒光免疫法能夠在稀釋 10 萬(wàn)倍的 SARS-CoV-2 受試者血漿樣本中準(zhǔn)確檢測(cè)出 SARS-CoV-2 刺突蛋白或核衣殼蛋白特異性 IgG 抗體。該方法還可檢測(cè)到其他抗體亞型。
- 使用了 SARS-CoV-2 刺突蛋白假病毒的穩(wěn)定檢測(cè)方法在稀釋倍數(shù)高達(dá) 10000 倍的 COVID-19 和恢復(fù)期血漿中均檢測(cè)到了中和作用。
- 檢測(cè)顯示了 COVID-19 患者體液免疫應(yīng)答的差異；具體來(lái)說(shuō)，重癥患者的抗體和中和滴度是門診或康復(fù)期血漿捐獻(xiàn)者的 3000 倍。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283620306732
Hattori, T. et al. The ACE2-binding Interface of SARS-CoV-2 Spike Inherently Deflects Immune Recognition. J Mol Biol. 433(3):166748.?2021.
詳細(xì)了解 SARS-CoV-2 刺突蛋白及其受體結(jié)合域 (RBD) 的免疫原性表面對(duì)于開發(fā)有效疫苗和基于抗體的治療手段至關(guān)重要。本研究利用 RBD 突變體作為表征 COVID-19 患者恢復(fù)期血清中抗 RBD 抗體的工具。數(shù)據(jù)顯示，RBD 的 ACE2 相互作用表面的免疫原性低于其他區(qū)域。作者使用先進(jìn)的高通量流式細(xì)胞術(shù) iQue? 系統(tǒng)進(jìn)行了基于細(xì)胞和微珠的結(jié)合檢測(cè)。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 對(duì)恢復(fù)期血清中抗體的結(jié)合分析表明，大多數(shù)抗體并不靶向 RBD 的 ACE2 相互作用表面。
- 使用人抗體噬菌體展示文庫(kù)進(jìn)行的無(wú)偏向性體外抗體選擇顯示，89% 的克隆體結(jié)合了刺突蛋白，但沒(méi)有結(jié)合 RBD 或 ACE2 結(jié)合表面。通過(guò)偏向性篩選識(shí)別出了靶向 ACE2 結(jié)合表面的抗體。
- 在無(wú)偏向性選擇中結(jié)合 RBD 的抗體則優(yōu)先結(jié)合未暴露于天然棘突蛋白三聚體的表面。