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從母血中分離純的單個(gè)胎兒細(xì)胞用于細(xì)胞性無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)

在產(chǎn)前護(hù)理中,有時(shí)需要獲取胎兒 DNA 以檢測(cè)發(fā)育中的胎兒是否患有遺傳疾病。常規(guī)的產(chǎn)前診斷方法如絨毛取樣 (CVS) 或羊膜腔穿刺術(shù)具有應(yīng)激性和侵入性,有自然流產(chǎn)的風(fēng)險(xiǎn)。而在妊娠早期,母體血液循環(huán)中可以發(fā)現(xiàn)一些來(lái)自胎兒的細(xì)胞。從母體血樣中分離這些胎兒干細(xì)胞是取代傳統(tǒng)程序的一種有利方法,此舉可以實(shí)現(xiàn)低風(fēng)險(xiǎn)的非侵入性產(chǎn)前檢測(cè) (NIPT檢測(cè)),同時(shí)能夠分離純的完整胎兒基因組(圖 1)。

圖 1.基于細(xì)胞的 NIPT (cbNIPT) 與傳統(tǒng)產(chǎn)前診斷方法和無(wú)細(xì)胞 NIPT (cfNIPT) 的定位示意圖(來(lái)自 Singh et al.)。cbNIPT 基于純胎兒細(xì)胞,不受母體基因組污染,顯示出與 CVS 等侵入性操作相當(dāng)?shù)姆治鰪?qiáng)度。該方法是一種基于抽血的檢測(cè),和 cfNIPT 一樣對(duì)孕婦的風(fēng)險(xiǎn)和壓力較低。

基于胎兒細(xì)胞和無(wú)細(xì)胞的 DNA 檢測(cè)

目前許多國(guó)家正在引入基于循環(huán) cfNIPT 分析的 NIPT。然而,該方法的主要難題在于胎兒基因組純度低,這是因?yàn)檠獫{中存在大量母體 DNA 以及 DNA 片段。因此,cfNIPT 往往難以可靠地檢測(cè)胎兒基因組中的非典型染色體畸變。要解決這一問(wèn)題,我們可以從母體血液中分離出純的完整胎兒細(xì)胞,并對(duì)全基因組擴(kuò)增的胎兒 DNA 進(jìn)行遺傳分析。

胎兒?jiǎn)渭?xì)胞分離的挑戰(zhàn)和解決方案

母體血液中循環(huán)的胎兒細(xì)胞數(shù)量極少:每毫升血液中只有 1-2 個(gè)胎兒細(xì)胞。因此,從母體血液中回收足夠數(shù)量的純胎兒細(xì)胞用于下游遺傳分析具有一定的技術(shù)難度。要實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn),需要高效的上游富集,使用足夠的細(xì)胞類(lèi)型特異性標(biāo)記進(jìn)行檢測(cè),并通過(guò)極其特異、精確和溫和的方式分離單細(xì)胞,從而最大限度地減少稀有細(xì)胞的損傷和丟失。通過(guò)基于 CellCelector 的胎兒細(xì)胞分離工作流程,可以快速且高精度地檢測(cè)富集血液樣本中的稀有細(xì)胞并溫和地回收單個(gè)胎兒細(xì)胞(圖 2)。

圖 2.使用 CellCelector 全自動(dòng)無(wú)損細(xì)胞分離系統(tǒng)從母體血液中分離單個(gè)胎兒細(xì)胞并進(jìn)行遺傳分析的典型工作流程。CFC:循環(huán)胎兒細(xì)胞;CMA:染色體微陣列分析;NGS:新一代測(cè)序。

圖 3.按照?qǐng)D 2 中描述的工作流程,使用 CellCelector 檢測(cè)胎兒細(xì)胞的示例。藍(lán)色:DAPI;綠色:胎兒細(xì)胞特異性抗體混合物 [圖片由 Arcedi Biotech 提供]

圖 4.CellCelector 系統(tǒng)自動(dòng)保存的挑取前和挑取后圖像示例。單細(xì)胞挑取效率:可達(dá)到100% [圖像由 Arcedi Biotech 提供]。

基于細(xì)胞的 NIPT 在臨床中的應(yīng)用

基于 CellCelector 平臺(tái)的新型 cbNIPT 方法的靈敏度和準(zhǔn)確性均已得到證實(shí),我們的客戶(hù) ARCEDI Biotech 已經(jīng)于 2018 年 5 月將該檢測(cè)方法引入丹麥中部地區(qū)的產(chǎn)前檢查中。在孕早期聯(lián)合篩查中確定為“高風(fēng)險(xiǎn)”(> 1:300) 的女性現(xiàn)在有機(jī)會(huì)在基于細(xì)胞的非侵入性檢測(cè)、無(wú)細(xì)胞NIPT或常規(guī)侵入性檢測(cè)之間做出選擇。新的 cbNIPT 方法可確保達(dá)100% 識(shí)別,即在所有情況下均可檢測(cè)和分離出胎兒細(xì)胞(圖 5)。每份樣本平均鑒定出 12.8 個(gè)胎兒細(xì)胞。下圖顯示了一個(gè)典型的分離后胎兒細(xì)胞圖庫(kù),以及使用此方法檢測(cè)到的染色體畸變示例。目前開(kāi)發(fā)的 cbNIPT 技術(shù)可以檢測(cè)非整倍體、微復(fù)制、不平衡結(jié)構(gòu)重排和mosaic 病例,并且可以識(shí)別 > 10Mb 的亞染色體畸變(圖 6)。最終目標(biāo)是為所有孕婦提供篩查檢測(cè)。

圖 5.從母體血液中富集并檢測(cè)到的頸項(xiàng)透明性增強(qiáng)的男性胎兒細(xì)胞(滋養(yǎng)層細(xì)胞)(來(lái)自 Vestergaard et al.)。細(xì)胞用 DAPI(藍(lán)色)和胎兒細(xì)胞特異性抗體混合物(綠色)染色。富集后使用 CellCelector 檢測(cè)和分離單個(gè)胎兒細(xì)胞,然后進(jìn)行 WGA 和 aCGH 分析。證實(shí) 21 號(hào)染色體非整倍體的結(jié)果如圖 6 所示(病例 1)。


圖 6.?5例細(xì)胞遺傳學(xué)異常的 aCGH 分析示例。1:21 三體;2:13 三體(mosaic);3:2 三體(mosaic);4:21 部分三體(12.4-Mb復(fù)制);5:不平衡易位,包括4p染色體上的31-Mb缺失和8p染色體上的30-Mb復(fù)制(圖來(lái)自Vestergaard等人)。在進(jìn)行侵入性檢測(cè)之前,所有的母親血液樣本都被收集用于cbNIPT,并進(jìn)行盲篩。


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